本文转自：环球网
“一针70万的天价救命药变3万。”因集采砍价，SMA（脊髓性肌萎缩症）近两年常出现在大众视野中。这一罕见病人群携带率为1/72-1/47，发病率为1/-1/，是婴幼儿中第二常见的致死性常染色体隐性遗传病。虽然有SMA治疗药物已纳入医保，但其终生治疗费用仍较为昂贵，且不能根治。因此，借助基因筛查，将这一潜在疾病扼杀在摇篮中，具有非常重要的意义。
在6月30日举办的媒体开放日活动上，贝瑞基因向外界公布了三代测序科研的最新进展：由公司参与完成的三代SMA（脊髓性肌萎缩症）临床回顾性研究成果，近期发表于分子诊断领域权威国际学术期刊JournalofMolecularDiagnostics（即时IF=5.）。
此次三代SMA研究成果由中国福利会国际和平妇幼保健院与贝瑞基因联合发表，中国福利会国际和平妇幼保健院王彦林教授和贝瑞基因毛爱平博士为这项研究的通讯作者。
贝瑞基因三代事业部总监任志林介绍，SMA携带者分三种情况：91-94%的携带者只有一个正常功能的SMN1拷贝（1+0），2-5%的携带者含有两个SMN1拷贝，但其中一个包含致病点突变（1+1D），另外4%为沉默型携带者，即有两个SMN1拷贝，但都位于同一条染色体上（2+0）。目前qPCR、MLPA等传统基因检测方法无法检测1+1D和2+0携带者，残余风险最高可达1/（1/-1/）。
任志林表示，三代测序具有超长读长、无GC偏好、对高度重复等复杂区域也能够准确测序等技术优势，且技术成本持续下降，年将实现与二代测序成本持平。在此基础上，贝瑞基因开发出三代SMA基因全面检测（ComprehensiveanalysisofSMA,CASMA）技术，全球首次实现SMN1及SMN2基因近30kb全长序列的高效率三代HIFI测序。CASMA还能同时检测SMN1及SMN2基因拷贝数、全基因范围内致病性SNVs及Indels，并主动提示沉默型“2+0”的携带风险。
此次三代SMA回顾性临床研究，CASMA一次性精准检测所有例样本的SMN1及SMN2基因拷贝数，对SMN1拷贝数缺失的检测灵敏度高达%。CASMA还成功检测出4例会被qPCR、MLPA等传统方法漏检的SMN1基因点突变携带者（1+1D）。通过专利分析方法，CASMA直接预测出全部7例（来自4个家系）已知“2+0”型携带者。数据显示，CASMA能大大改善SMA患者基因诊断及预后判断，提高SMA新生儿基因筛查效率，将携带者检出率从91-94%提高到98%以上，将残余风险降低4-5倍。
这一研究成果意味着全面、高效的SMA筛查成为可能。实际上，除了三代SMA，贝瑞基因还将三代测序技术触达多种罕见病，三代地贫、三代CAH等产品相继落地。其中，三代地贫检测试剂盒近期取得医疗器械注册伦理批件，进入临床试验阶段。三代CAH和三代SMA技术则在年双双取得发明专利证书。
对于贝瑞基因在三代测序仪上的布局，任志林表示，将继续放在遗传疾病的筛查和诊断领域。“三代测序仪可以提供比较精准的全基因级别的遗传信息，可以大大提高目前国内一二三级出生缺陷防控和基因病诊断的效率。”
利用三代测序技术，未来能否出现一次检测多种罕见病的产品？任志林表示，因为公司的各种产品是高度兼容，所以更容易实现一次性解决多种疾病，而从一到多，准确性不会受到影响。“但在成本方面和药监注册方面需要有一定的考量。”
对于三代测序仪的发展计划，贝瑞基因市场部总监赵智贤博士介绍，根据贝瑞基因目前的发展策略，是在三代测序仪上开发单病的复杂结构基因突变或者基因结构导致的单病一次性测定方法和试剂盒；未来则是随着临床的验证和市场的接受，逐渐将这些单一产品打包整合，让越来越多的疾病纳入到二代和三代的平台上，形成一套有效的、能一次性测定指定病种致病基因情况的产品。
赵智贤表示，三代基因检测可以一次性解决复杂基因结构的各种基因型问题，远远超过了目前临床的常规水平，因此有大量的不同应用场景。
“未来随着三代测序技术的成本下降，以及临床对三代测序技术越来越了解，用起来更加得心应手，相信无论是从临床层面还是从国家对出生缺陷防控的需要，将来在多病种方面三代测序的份额会越来越大。”赵智贤谈到，未来最大的应用场景还是携带者筛查，随着数据量越来越大，得到更广泛的临床认可，市场也将迎来爆发。
对于三代测序技术的未来，贝瑞基因董事长、总经理高扬充满信心，他表示，我们非常希望能抓住技术跃迁的机遇，在未来的临床场景做到全基因病的筛查和未明确疾病的诊断，成为临床和患者之间的桥梁，践行企业使命，实现价值增长。