丙肝病*基因分型及临床意义
慢性HCV感染日益成为一个世界范围内的公共健康问题，是全世界慢性肝病及死亡的一个主要原因。丙型肝炎可引起肝硬化、消化道出血、肝衰竭及肝癌，是欧美国家肝移植的主要原因。虽然目前有非常有效的治疗手段可以消除60%CHC患者体内的HCV，并且可以降低其余40%慢肝患者发展为肝硬化的概率。但不幸的是，即使在发达国家，由于缺乏充分的诊断和治疗，丙型肝炎引起的病死率仍呈上升趋势。
随着多款丙肝直接抗病*药物(DAAs)在国内获批，使丙肝治愈率达99%以上，而丙肝的早期发现及准确诊断对于丙肝的治愈尤为关键。
1、HCV分型流行病学
目前，根据全世界不同地区分离的HCV不同株的全部或部分基因组系统进化分析，HCV呈现3个水平的遗传变异性：型（types）、亚型（subtypes）、准病*株（quasispecies）。HCV至少可分为6个基因型（HCV1～6型），包含超过个基因亚型（如1a、1b、1c、2a、2b等）。各型核酸序列之间相差31%~34%，氨基酸序列相差大约30%，而亚型序列之间相差约20%~23%，准病*株序列之间相差1%~10%。最多的差别序列集中在E1和E2区，而core基因和一些非结构蛋白基因例如NS3则相对保守得多。各型之间序列最为保守的区域是5′UTR区。
HCV1b和2a基因型在我国较为常见，其中以1b型为主（56.8%），其次为2型（24.1%）和3型（9.1%），未见基因4型和5型报告，6型相对较少（6.3%）。
2、HCV基因分型方法
对HCV基因组的某些区域（E1、NS5B）直接进行序列分析和系统进化分析，是HCV分型的“金标准”。目前，针对HCV5′UTR区序列多态性进行基因分型的技术有以下几种：
①基因型特异性引物扩增片段分型(PCR-荧光探针法)：根据不同HCV型在某一区段序列的差异，设计一系列特异性引物，不同型可扩增出不同的片段，并以此进行分型。这种方法对PCR引物的设计要求较高，要保证各型之间有较大差异，且每份样品需同时进行多次检测才能最终确定型别。
②型特异性核酸探针杂交分型法：根据各型HCV某一区段的序列差异分别设计探针，与PCR产物杂交后进行PCR分型。目前获批的进口丙肝分型试剂使用方法就是型特异性核酸杂交分型方法，为最成熟的一种技术方案。
③Sanger测序法，是目前丙肝分型的最准确方法--“金标准”，可对HCV进行序列逐一分析，从而确定其型别。
3、HCV基因分型临床意义
3.1了解HCV型别进化、分布特征及探讨HCV传播途径
HCV基因型的研究为了解各型HCV在进化中的出现和变化提供线索，有助于了解全球丙型肝炎的流行病学情况。据估计，HCV与人类一起在10～15万年前从非洲迁移出来并共同进化，但目前的HCV型别是近世纪才出现的。一项研究表明，HCV6型起源于年前，HCV4型起源于年前，而HCV1a、1b则可能起源于近年前。在发达国家，HCV主要型的一些亚型在数十年前已经出现，并通过不同途径传播，其中主要有HCV1a、1b、2a、2b、2c、3a和4a。
从上世纪60年代至今，HCV1a、3型在静脉注射*品者中迅速广泛的流行起来。在过去30～70年里在西方国家出现大量感染。在过去10年间，HCV1a、3a感染相对HCV1b明显增多，因为静脉注射*品是目前HCV传播的主要途径，占新发病例的70%左右。有趣的是，由于系统化的血液和血制品筛查的普及，现在HCV1b的遗传进化步伐已大大减慢。相对的，在静脉注射*品者中HCV感染的流行已失控，这与HCV1a、3a型的快速遗传进化相关。
3.2预测病情
在HCV感染的整个过程中，宿主内HCV的疾病表现有明显的生物学差异。某些人群感染HCV后会在短时间内出现严重的并发症，如肝纤维化和肝癌；而某些人群即使感染时间很久也无任何并发症。因此，很有可能存在病*或宿主方面的因素，包括HCV基因型，会导致这种疾病感染的进程。
目前，部分研究者们十分支持HCV基因型影响肝脏疾病进程的说法。有研究报道在慢性HCV感染患者中，与其他基因型相比，HCV1b型感染与更严重的肝脏疾病、更迅速的疾病恶化相关。Zein等发现HCV1b基因型在肝硬化和肝脏失代偿要求肝移植的慢性活动性丙型肝炎患者中的感染率远远高于其他基因型。
3.3预测治疗反应
研究认为HCV1b及1a基因型比HCV2型或3型对干扰素治疗的应答反应更差。中国丙肝防治指南（年更新版）对于1型和其它型别的丙肝PR治疗方案（干扰素+利巴韦林）有显著差异，1型治疗周期更长。
不同HCV基因型患者，采用的DAAs治疗方案和疗程亦有不同。目前泛基因型抗病*药虽已获批上市，但尚未完全普及，且疗程费用可能较高。因此，患者用DAA抗病*治疗前，需要检测HCV基因型，甚至针对基因1型患者，需要区分是1a型还是1b型，从而选择合适的、效价比高的抗病*治疗方案。
达安基因丙肝分型分子检测产品
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*技术原理:采用Sanger测序法对HCV基因组RNA的core/E1区进行序列分析
*检测范围：检测HCV1b、2a、3a、3b、6a常见型别，HCV其它型别也可分型，但不能区分混合型感染。
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